Practical course - Applied Structure-Based Drug Design

Applied Structure-Based Drug Design - zweiwöchiges Blockpraktikum

Keine Plätze mehr frei!

Im Praktikum Strukturbasierter Wirkstoffentwurf werden wir uns mit grundlegenden Techniken des computergestützten Wirkstoffentwurfs beschäftigen. Dazu werden wir die Programmpakete BALLView, VMD, Glide, Prime und Modeller verwenden.

In der ersten Woche steht die Aufbereitung und Visualisierung von 3D Strukturen im Vordergrund. Außerdem werden spezifische intramolekulare Wechselwirkungen von Protein-Ligand-Komplexen genauer betrachtet und ausgewählte Liganden in ein pharmazeutisch interessantes Target gedockt. Im zweiten Teil des Praktikums stehen virtual high-throughput screening und gezielter strukturbasierter Wirkstoffentwurf im Mittelpunkt.

Termin

Das Praktikum findet als zweiwöchige Blockveranstaltung statt: 04.03.-14.03. immer von 9-16 Uhr

Den Termin der ersten Vorbesprechnung: 05.11.2012 um 14.00 Uhr in C311

Bemerkungen

  • Vorraussetzung an der Teilnahme des Praktikums ist ein abgeschlossenes Grundstudium der Bioinformatik (für Diplomstudenten) oder man ist Student/-in des Masterstudiengangs der Bioinformatik. Interessierte von anderen Studiengängen dürfen sich gerne bei uns melden.
  • Die Anzahl der Teilnehmer ist auf 6 begrenzt
  • Vorlesung Proteinstruktur und –modellierung oder DrugDesign wird empfohlen oder gute Kenntnisse in Strukturbiologie

Kontaktpersonen

Jens Krüger

Charlotta Schärfe

Anmeldung

per email an: schaerfe at informatik.uni-tuebingen.de

Bei Unklarheiten oder Fragen zu den Terminen dürft ihr mir auch gerne eine email schreiben.