Practical course - Applied Structure-Based Drug Design

Applied Structure-Based Drug Design - zweiwöchiges Blockpraktikum

Im Praktikum Strukturbasierter Wirkstoffentwurf werden wir uns mit grundlegenden Techniken des computergestützten Wirkstoffentwurfs beschäftigen. Dazu werden wir die Programmpakete BALLView, VMD, Glide, Prime und Modeller verwenden.

In der ersten Woche steht die Aufbereitung und Visualisierung von 3D Strukturen im Vordergrund. Außerdem werden spezifische intramolekulare Wechselwirkungen von Protein-Ligand-Komplexen genauer betrachtet und ausgewählte Liganden in ein pharmazeutisch interessantes Target gedockt. Im zweiten Teil des Praktikums stehen virtual high-throughput screening und gezielter strukturbasierter Wirkstoffentwurf im Mittelpunkt.

Termin

Das Praktikum findet als zweiwöchige Blockveranstaltung statt: Mo-Mi (20.2.-22.2.) und Mo-Fr (27.2.-2.3.) immer von 9-16 Uhr

Den Termin der ersten Vorbesprechnung: 17.10.2011 um 10.00 Uhr in C311

Bemerkungen

  • Vorraussetzung an der Teilnahme des Praktikums ist ein abgeschlossenes Grundstudium der Bioinformatik (für Diplomstudenten) oder man ist Student/-in des Masterstudiengangs der Bioinformatik. Interessierte von anderen Studiengängen dürfen sich gerne bei uns melden.
  • Die Anzahl der Teilnehmer ist auf 6 begrenzt
  • Vorlesung Proteinstruktur und –modellierung wird empfohlen oder gute Kenntnisse in Strukturbiologie

Kontaktpersonen

Nina Fischer

Jens Krüger

Anmeldung

per email an: nfischer at informatik.uni-tuebingen.de

Bei Unklarheiten oder Fragen zu den Terminen dürft ihr mir auch gerne eine email schreiben.