Computational Immunomics (BIOINF 3360)

Diese Vorlesung bietet eine Einführung in die Welt der Immunoinformatik. Sie beschäftigt sich mit der Anwendung von Informatikmethoden zur Lösung immunologischer Probleme, z.B. der Entwicklung neuartiger Impfstoffe.


Die Projektpräsentationen finden am 5.7. zwischen 13:45h und 16:00h statt.



Leistungspunkte


  • Wpfl. Bioinformatik/Systembioinformatik (BSc BI): 4LP
  • Wpfl. Informatik/Ausgewählte Themen der Bioinformatik (BSc Inf, MedienI): 4LP
  • Diplom Bioinformatik/Informatik: praktische Informatik, 2+1
  • Benotung: Klausur oder mündliche Prüfung 50 %, Übungsblätter 25 %, Projektarbeit 25 %
  • Anwesenheitspflicht in der Übung

 

Zeit und Ort


Vorlesung: Dienstag, 14:15-16:00 Uhr, F119

Übung: Dienstag, 13:15 - 14:00 Uhr, F119 (unregelmäßig) 

Die erste Übung findet am 10.05. statt.

Die zweite Übung findet am 17.05. statt.

 

Umfang der Veranstaltung: Vorlesung (2) + Übung (1)

 

Links


 

Themen der Vorlesung


  • Was ist Immunoinformatik?
  • Eine kurze Einführung in die Immunologie
  • Machine Learning Methoden in der Immunoinformatik
  • Vorhersage von MHC-Peptid-Bindung
  • Vorhersage von Antigenprozessierung
  • Impfstoffentwurf
  • Systemimmunologie

 

Empfohlene Literatur


  • Goldsby, Kindt, Osborne, Kuby: Immunology (5th ed.), Freeman, 2003
    (additional information www.whfreeman.com/immunology5e)
  • Janeway, Travers, Walport: Immunobiology (5th ed.), Livingstone, 2004
    ( searchable book at the NCBI website)
  • Hastie, Tibshirani, Friedman: The Elements of Statistical Learning Springer, 2001
  • H.G. Rammensee (ed.): Immunoinformatics, Wiley, 2003
  • Christianini, Shawe-Taylor: An Introduction to Support Vector Machines and other kernel-based learning methods, Cambridge U Press, 2000
  • Lund, Nielsen, Lundegaard, Kesmir, Buus: Immunological Bioinformatics, MIT Press, 2005
  • Benoist, C and Germain, RN and Mathis, D. A Plaidoyer for 'Systems Immunology'. Immun. Rev. (2006) 210(1):229-234.  http://www3.interscience.wiley.com/journal/118595625/abstract

 

Dozenten


 



Contact: ci@informatik.uni-tuebingen.de