Proseminar Introduction to Structural Bioinformatics

Dieses Proseminar bietet einen ersten Einblick in die faszinierende Welt der 3D Strukturen von Proteinen, DNA und RNA. Wir werden strukturbasierte Probleme der Bioinformatik und ihre Lösungsansätze kennenlernen und ausgewählte Themen genauer betrachten.

Themen


Als Grundlage für das Seminar dient das Buch von Bourne und Weissig Structural Bioinformatics :

 

  • Grundlagen der Proteinstruktur (Kapitel 1+2 , Introduction to protein structure (Branden+Tooze))
  • Grundlagen der Röntgenkristallographie (Kapitel 4 + Crystallography made crystal clear(Rhodes) )
  • Strukturklassifizierung (SCOP,CATH Kapitel 12+13)
  • Vergleich von Proteinstrukturen (Kapitel 16)
  • Sekundärstrukturvorhersage (Kapitel 17)
  • Grundlagen des Docking (Kapitel 22)
  • ab-initio Strukturvorhersage (Rosetta)
  • CASP, Homologiemodellierung (Kapitel 25)

 

 

Ort und Zeit:


  • Das Proseminar findet immer dienstags um 9:15 Uhr in C311 statt.

  • Der Termin für die Vorbesprechung ist am: Dienstag, 13.4.2010 um 9:15 Uhr in C311.
  • Für Fragen zu den Themen oder auch zur Zeit/Ort des Proseminars sind wir jederzeit per email zu erreichen: Nina Fischer oder  Marc Röttig

 

 

Dozenten


Oliver Kohlbacher, Nina Fischer, Marc Röttig

Kontakt: Nina Fischer